Breng in een grote pan een ruime hoeveelheid water aan de kook met een flinke snuif zout.
Pel de uien en snij ze in fijne ringen. Bak ze goudbruin in de helft van de boter.
Vermeng de gezeefde bloem met de eieren en de melk tot een glad beslag. Kruid met noosmuskaat en zout. Schep met een lepeltje kleine porties van het deeg in het kokende water. Laat ze een paar min. sudderen tegen de kook aan tot ze komen bovendrijven, dan zijn ze gaar. Laat de rest van de boter smelten (maar niet kleuren) in een pannetje. Schep de spätzle met een schuimspaan uit het wate bij de gesmolten boter. Strooi er de kaas bij en schep goed om. Werk af met de gebakken uiringen en serveer meteen.